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江浙滬漢族人群HLA-A*02組等位基因多態性分布

來源:《中華醫學研究雜志》 作者:謝軍華,杜可明,季 蕓,楊建豪,黃 慧,沈 彤,馮 2008-7-4

摘要: 【摘要】 目的 調查江浙滬漢族人群健康無關個體A*02組等位基因多態性并分析不同人群A*02組等位基因頻率分布特征。方法 利用Luminex技術對江浙滬地區3000名健康無關漢族人進行HLA-A*02組等位基因分型,可檢出HLA命名委員會(WHO Nomenclature)2007年正式命名的所有HLA-A*02組等位基因,計算等位基因頻率并與不同......


【摘要】  目的 調查江浙滬漢族人群健康無關個體A*02組等位基因多態性并分析不同人群A*02組等位基因頻率分布特征。方法 利用Luminex技術對江浙滬地區3000名健康無關漢族人進行HLA-A*02組等位基因分型,可檢出HLA命名委員會(WHO Nomenclature)2007年正式命名的所有HLA-A*02組等位基因,計算等位基因頻率并與不同人群多態性分布特征進行差異性比較。結果 江浙滬漢族人群共檢出HLA-A*020101、A*020301、A*0202、A*020103和A*0245等5個等位基因, 其余等位基因未檢出。3000名無關個體中HLA-A*02等位基因頻率為0.3062,是頻率分布最高的HLA-A基因座等位基因,其中HLA-A*020101等位基因頻率最高,達到0.2787。江浙滬漢族人群HLA-A*02組各等位基因多態性分布與其他人群差異性比較均有統計學意義(P<0.05)。結論 HLA-A*02組各等位基因多態性分布具有明顯的種族和地域特征。

【關鍵詞】  江浙滬漢族人群;HLA-A*02組;基因頻率


    Polymorphism of HLA- A*02 group alleles in the Jiangsu-Zhejiang-Shanghai Han population

    XIE Jun-hua, DU Ke-ming, JI Yun, et al. Shanghai Blood Center, Shanghai, 200051, China.

    【Abstract】  Objective  To investigate the polymorphism of HLA- A*02 group alleles in Jiangsu-Zhejiang-Shanghai Han population and analyze the characteristic of the allele frequency distribution in comparison with other populations. Methods  A total of 3,000 blood unrelated healthy individuals were genotyped for HLA- A*02 group alleles by Luminex technology. Unrelated individuals were collected from Chinese Han population in Jiangsu- Zhejiang-Shanghai area. All of HLA- A*02 group alleles which were nominated by HLA Nomenclature Committee (WHO Nomenclature) in 2007 were detected in this study. Allele frequency was calculated, and the polymorphism of allele frequency distribution was compared with other populations. Results  Five alleles including HLA- A*020101, A*020301, A*0202, A*020103 and A*0245 were detected in Jiangsu-Zhejiang-Shanghai Han population, but others were undetected. HLA- A*02 was the most common allele(0.3062)of HLA-A locus, and HLA- A*020101 was the most common allele (0.2787) of HLA- A*02 allele in 3,000 unrelated individuals. As compared with other populations, there was significant difference in polymorphism of HLA- A*02 group alleles of Jiangsu-Zhejiang-Shanghai Han population (P<0.05). Conclusion  The polymorphism of HLA- A*02 allele frequency distribution shows obviously ethnic and regional characteristic.

    【Key words】  Jiangsu-Zhejiang-Shanghai Han population; HLA-A*02 group; allele frequency

    HLA位于人類第6號染色體短臂6p21.3區域,長約3500kb,具有高度的遺傳多態性,不同地域和種族多態性分布差異性較大[1]。HLA基因復合物的編碼產物參與抗原識別、遞呈及T細胞激活,在免疫應答的啟動和免疫調節中起著非常重要的作用。HLA-A2于1965年被首次發現, 1967年被正式命名[2],是最常見的HLA-A座位抗原,也是目前發現的抗原編碼等位基因數最多的一個,其在不同人種中均有較高的頻率分布。本文采用流式熒光技術檢測的方法,對3000名江浙滬地區健康漢族無關個體進行HLA-A*02組等位基因分型,并與不同人群進行多態性分布差異性比較,現將結果報告如下。

    1  材料與方法

    1.1  檢測樣本  江浙滬地區漢族人群無關個體3000名, 采集5ml靜脈血于真空EDTA抗凝采集管,充分混勻,所有樣本均知情同意。

    1.2  DNA抽提  采用美國Gentra公司試劑盒抽提DNA,具體操作見廠商說明書。

    1.3  基因分型  利用白細胞抗原系統流式(Luminex技術)檢測試劑盒,戴諾生物技術(北京)有限公司提供,具體操作參照說明書。 

    1.4  統計學分析  利用基因直接計數法計算HLA-A*02組各等位基因頻率。并運用軟件SPSS10.0比較江浙滬漢族群體與其他不同人群HLA-A*02(*0201-0207)組等位基因多態性分布差異,由于在所比較人群中A*0207后等位基因非常罕見,意義不大,不納入比較范圍。

    2  結果

    2.1  江浙滬漢族人群HLA-A*02組等位基因頻率分布  在所檢3000名樣本中共檢出A*020101 、A*020103、A*0202、A*020301和A*0245等5種HLA-A*02組等位基因,其中A*020101 基因頻率0.2787,詳見表1。

    2.2  江浙滬漢族人群與不同人群HLA-A*02組等位基因多態性分布差異性比較  通過www.allelefrequencies.net查詢得到不同人群HLA-A*02組等位基因頻率分布數據,見表2。江浙滬漢族人群HLA-A*02組等位基因頻率分布與中國南北漢族群體差異性比較有統計學意義(P<0.05), 與黑人、白人比較也有統計學意義(P<0.05),詳見表2。表1  中國漢族群體HLA-A*02組等位基因頻率分布(略)表2  江浙滬漢族與不同人群HLA-A*0201~0207多態性分布差異性比較(略)注:*P<0.05,有統計學意義

    3  討論

    HLA作為個體組織細胞的遺傳標志,在抗原識別、遞呈、免疫應答與調控等方面,起著非常重要的作用,是影響造血干細胞移植成敗和器官移植物長期存活的關鍵因素之一[3],因此對HLA抗原的等位基因進行分型顯得尤為重要。本文采用Luminex技術對江浙滬地區3000名健康無關漢族人進行HLA-A*02組等位基因分型。

    從表1可見,3000名江浙滬漢族樣本中共檢出5個HLA-A*02組等位基因,A*0201和0203是常見等位基因,頻率分別達到0.2792和0.0248。絕大多數人群HLA*0201是常見等位基因,在所有人種中均有檢出。但中國南方漢族、黑人頻率分布相對較低。A*0202在黑人中頻率分布較高。A*0203、0207僅見于黃種人。A*0204在黑人中有分布,但頻率也較低。A*0205在北方漢族、黑人和白人中有分布,但在沙特阿拉伯人(白人)和喀麥隆黑人頻率分布較高(>5%)。

    從表2可見,江浙滬漢族人群HLA-A*02組等位基因頻率分布與中國南北漢族群體和其他不同人群差異性比較均有統計學意義(P<0.05), 說明HLA-A*02組等位基因分布具有明顯的地域和種族特征。

    綜上所述,由于HLA-A*02等位基因多態性具有遺傳異質性,提示既往血清學分型HLA-A2相符的器官移植供受體在基因水平上可能存在一定比例的錯配[4],因而強調對HLA-A2作高分辨率基因分型以篩選合適供體,對異基因骨髓移植有重大意義[5]。

 

【參考文獻】
  1 Feng ML, Ji Y, Lu Q,et al.Study on HLA Haplotypes in the Jiangshu-Zhejiang-Shanghai Han Population. Current Genomics,2005,6:109-114.

2 趙桐茂.HLA分型原理及應用.上海:上海科技出版社,1984,139.

3 Cho Y W,Cecka J M,Terasaki P I. HLA matching effects: better survival rates and graft quality. In: Terasaki P I, Cecka J M E ed. Clinical Transplants 1994. LOS Angeles: UCLA tissue typing laboratory,1995,435-449.

4 Bunce M,Fanning GC, Welsh KL. Comprehensive,serologically equivalent DNA typing for HLA-B by PCR using sequence-specific primers(PCR-SSP). Tissue Antigens,1995,45:81-90.

5 Browning M,Krause P. Genetic diversity of HLA-A2: Evolutionary and functio nal significance. Immunol Tody,1996,17:165.


作者單位:200051 上海,上海市血液中心


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