主題:研究者

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研究者們首次發現了大腦最早的阿茲海默癥癥狀

最近,來自Lund大學的研究者們首次發現了大腦最早的阿茲海默癥癥狀。這一發現對于未來的阿茲海默癥研究以及早期診斷具有重要的意義。在阿茲海默癥發病過程中,大腦的變化主要是beta-淀粉樣蛋白質的...即將發布

日期:2017年11月6日 - 來自[新藥]欄目
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研究者們解開乳腺癌“暗物質”之謎

雖然癌細胞基因組中的蛋白質編碼基因往往存在突變現象,但對于非編碼區域來說,它們的突變也會導致腫瘤的生長。最近一項研究則從乳腺癌中找到了這樣的例子。雖然癌細胞基因組中的蛋白質編碼基因往往存在突變現象,但...即將發布

日期:2017年7月4日 - 來自[技術要聞]欄目

BMC Biol:男人和女人的差異在哪里?6500個基因解釋差異所在!

圖片摘自:WeizmannInstituteofScience男性和女性在很多方面表現不一樣,比如特定疾病的流行率以及對藥物的反應等,那么這種現象和性別到底有什么關系?近日一項刊登在國際雜志BMCBi...即將發布

日期:2017年5月9日 - 來自[技術要聞]欄目
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科學家如何解密癌癥大數據信息?

感謝成像領域、模型研究以及遺傳學研究的進展,如今大量的數據源源不斷地涌入癌癥研究者的手中,如今臨床試驗中來自單一患者腫瘤的相關數據量已經高達1TB了,這些數據信息量相當于13萬本書的內容。

但如今研究者仍然缺乏工具來有效處理這些大量的遺傳數據從而為療法的開發進行精準地預測,而治療癌癥似乎依然是研究者未來的一個終極目標,目前研究者并不能準確預測特定的腫瘤如何對任何給定的藥物產生反應,以及患者如何進行治療,是否癌細胞能夠不斷進化從而使得療法失效等等問題。

如今來自美國能源部和國家癌癥研究所進行聯合研究來抵御癌癥,在一項為期三年的研究計劃中,研究人員就利用了美國能源部的超級計算功能構建了復雜的計算機模型,從而就能夠在分子、病人以及群體水平上來研究抵御癌癥的策略。這項研究計劃基于美國總統奧巴馬提出的精準醫療計劃以及副總統近日提出的癌癥探月計劃,的確研究者的目的是針對個體不同的狀況實現個體化的診斷和癌癥治療。

來自美國國家癌癥研究所的研究者Warren Kibbe說道,癌癥研究者們非常擅長通過基因組數據、蛋白質組數據以及成像數據得出多種類型的數據,但我們并不擅長如何將這些信息數據進行整合,使其成為一種一致性的模型,并且有效預測腫瘤是否會對既定的療法產生反應。

CANDLE

合作的關鍵在于計算機框架,其名為“癌癥分布式學習環境計劃”( CANcer Distributed Learning Environment,CANDLE)。過去很多年里,科學家們進行了多項研究計劃,評估了大量的癌癥研究數據,其中包括腫瘤的基因組、病人的數據以及多項潛在藥物的臨床數據等,CANDLE的設計就是利用機器學習算法來在大型數據庫中尋找合適的模式,機器的學習就是一類人工智能,其重點關注于那些能夠教授我們處理數據的一些程序,這些模式或許最終就能夠幫助改善患者的療法或指導科學家進行新的實驗。

截止到目前為止,很多機器學習相關的研究都產生了新型的計算機模型來在單一的數據點評估藥物的的反應,然而研究者們想象到了一個更高程度的復雜性并且整合了多種類型的信息,比如藥物反應和患者譜系特殊性等。

分子水平上的研究

30%的癌癥都表現出了Ras家族的突變,Ras蛋白家族能夠幫助誘導細胞機器制造新型細胞或殺滅老細胞。研究者Lawrence Livermore就進行的是分子水平上的試點研究,他利用CANDLE架構來預測Ras蛋白家族蛋白如何在細胞膜上發揮作用,隨后他將相關信息加入到了Ras通路問題的研究上,Ras通路問題會導致基因停留在“開啟”的位置從而引發腫瘤

研究者想進行高度復雜性的模擬來描述細胞膜上蛋白質如何移動以及如何結合到特殊位點,他們希望將這些信息能夠應用于數百萬個Ras通路上,并且明顯增強他們的理解,從而預測單一信號在疾病發生過程中的作用。

病人水平上

癌癥往往包含著成百上千種疾病,每一種都有著不同的發病原因,因此對于特殊患者而言將精準化引入到療法選擇中或許就是研究者在病人水平上進行研究的終極目的。在CANDLE平臺的幫助下,研究人員開發了新型的預測模型,其基于更廣泛的多種數據能夠引導針對不同腫瘤的療法選擇。

研究者Kibbe說道,研究者們或許會去嘗試尋找特殊腫瘤逃脫療法獲產生耐藥性的機制,從概念上而言,未來的癌癥療法或許是不斷改進變化的,如今我們并不理解癌癥對于任何特殊療法所產生的耐藥性對于預測組合性療法效果的生物學意義,但我認為,模擬將能夠幫助我們更好地預測組合性療法對特殊患者的有效性及重要性。

群體水平上

在任何一個時間點,3%至5%的癌癥患者都會參與到癌癥臨床試驗中,而且對患者研究數據的分析編目也仍然是一項非常巨大的手工任務;美國橡樹嶺國家實驗室(Oak Ridge)就將幫助國家癌癥研究所的研究者,通過自動化的樣品讀取及分析過程來監測癌癥患者的變化,通過將自然的語言處理及機器學習算法應用到數百萬份臨床報告中,計算機就會從醫生和護士筆記本的信息中提取出有效的東西進行加工。

加工完成后,系統就會自動分析并且提取相關信息以便科學家們監測遍布全球的結果,隨后就能指導不同生活方式、環境以及癌癥類型的患者進行治療;檔案在進行群體水平的試點研究之前研究者們必須對數據進行去識別化操作。

下一步該怎么做?

在接下來3年里,美國國家癌癥研究所及能源部的研究者將會進行一項巨大任務,對此研究者們是由計劃的,首先第一年他們講重點關注合并統計學模型并且構建機器學習方法來對現象進行最好地解釋和預測;第二年計算機科學家將會利用計算機進行推斷他們對這些預測結果的自信程度;最后一年研究者們將會把所有的信息相結合,同時整合后進行試驗性設計分析。

研究者Stevens表示,此刻我們處于一種特殊的階段,如今在政府部門間出現了一些讓人難以置信的談話,關于如何整合大數據以及信息來理解疾病的發病機制等信息,如果我們能夠理解突變、正常生物學過程以及癌癥之間的相互作用,那么我們或許就有望對疾病進行干預或預測。

Stevens已經從事了將近20年的計算生物學領域研究,他表示如今他們面臨了很多問題,而且他們也并不確定如果他們真的那樣做會帶來什么后果,但如今癌癥探月計劃給他們帶來了動力,研究者認為,隨著后期深入的研究以及多種信息的整合,未來或許有望早期破解癌癥大數據,從而為開發新型個體化癌癥療法提供新的思路和希望。

日期:2016年10月25日 - 來自[腫瘤相關]欄目

新一代的抗瘧疾藥物或將問世

發表于國際雜志Nature上的一項研究論文中,來自斯坦福大學的研究人員通過研究開發了一種新型可以有效抑制惡性瘧原蟲(Plasmodium falciparum)的治療性化合物,惡性瘧原蟲是一種引發個體患瘧疾的寄生蟲,其每年都會引發很多患者死亡;這種化合物可以使得對瘧原蟲生命周期非常必要的酶類復合物失活,同時這種酶類也可以作為一種重要靶點來幫助開發抵御耐藥性瘧疾的新型療法。

研究者Richard Conroy博士指出,瘧疾的影響非常廣泛而且嚴重,目前我們迫切需要尋找方法在降低藥物副作用及瘧原蟲耐受性的前體下,來盡可能提高療法的治療效果;本文研究中研究者就提供了一種新型方法來幫助開發新型方法或藥物來對靶點酶類進行有效作用,并且有效增強當前抗瘧疾藥物的效率。

文章中,研究者利用電鏡來研究蛋白酶體的結構,蛋白酶體是人類細胞中用于進行蛋白質循環及完成細胞過程的關鍵蛋白酶復合物,寄生蟲依賴于這種復合物來快速在宿主細胞中分裂;研究人員Matthew Bogyo對蛋白酶體進行了20多年研究,開始研究時他們發現基于蛋白酶體的藥物可以作為多發性骨髓瘤的新型療法。Bogyo說道,我們非常感興趣將蛋白酶體作為一種新型靶點進行研究,如果我們可以抑制這種酶的功能,就可以有效抑制處于生命周期不同階段的瘧原蟲的生長,從而抑制瘧原蟲的傳播及感染,然而首批研究結果顯示,可以有效殺滅小鼠機體中瘧原蟲的蛋白酶體抑制劑同時也對瘧疾感染的動物具有毒性作用。

為此研究者就需要利用一種系統性的方法,來真正篩查人類和瘧原蟲蛋白酶體之間的差別,隨后他們利用質譜法建立了人類和瘧原蟲種蛋白酶體的特性,研究者們尋找到了每一個蛋白酶體所傾向的特殊蛋白片段,而這也將幫助研究人員有效區分人類和瘧原蟲種酶類的差異。研究者隨后利用低溫電鏡術對瘧原蟲蛋白酶體的結構進行了多張成像,基于對這些圖像的分析,研究人員就可以確定瘧原蟲在人類和動物宿主血液中的兩個生命周期階段中如何對抑制性化合物變得敏感。

研究者Bogyo及其團隊目前正在繼續從事研究來改善這種化合物的潛能,同時他們還開發出了一種新型算法來幫助進行每日的藥物口服管理,以便這種新型化合物可以同當前的抗瘧疾藥物相結合,未來研究者們將繼續深入研究來不斷優化這種化合物和多種檢測試驗,未來研究者希望這種化合物可以早日推向臨床中去。

(本文系轉載,如有侵權,請聯系刪除。)

日期:2016年3月16日 - 來自[新藥]欄目
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澳大利亞研究者發現辣椒可成為減肥秘方


澳大利亞阿德萊德大學的研究者近日發現,在辣椒中一種化學物質可幫助人們減少食量從而達到減肥的目的。

據澳大利亞廣播公司報道,該校研究者一直在探尋辣椒中的化學物質是如何刺激胃部神經并向大腦傳遞胃部已飽和信息的。他們還發現,高脂膳食可能削弱胃部神經傳遞飽和信號的功能,導致人們暴飲暴食。

阿德萊德大學營養與胃腸疾病研究中心的斯蒂芬·肯蒂什博士表示,之前的研究已經證明辣椒里的辣椒素能夠幫助人減少食物攝入量。此次研究已經確定,如果去除被研究的老鼠胃部的這種化學感受器,讓神經對辣椒素的刺激無法做出反應,她們會吃掉更多的食物。這也表明,這在控制食物攝入量上起關鍵作用。

肯蒂什表示,將要開發一種化學藥品,使人們在吃含有大量辣椒的食物時沒有辛辣的感覺,以適應絕大多數人的食用需求,達到減肥和抑制增肥的目的。


日期:2015年8月21日 - 來自[減肥知識]欄目

王辰院士:臨床醫生都應是研究者

 

“我國的臨床醫學研究,資源豐富,但卻涉獵粗淺、觀念落后,同時成果又最實用、需求最急迫。”近日,在“第五屆重大疾病防治科技創新高峰論壇”上,中國工程院院士、中日友好醫院院長王辰在題為《我國臨床醫學研究體系與能力建設》的報告中提出,臨床研究是醫生的天職天命。

目前社會上有種偏見,認為醫生可以不作研究,甚至有人將醫生與研究割裂開來。但在王辰看來,醫生注定就是研究者。

“醫生的學識與技能來源,有直接經驗和知識,也有間接經驗和知識。直接的經驗與知識,既有醫療實踐,需要醫生在‘摸爬滾打’中積累經驗;也要源于醫療實踐,發現診療與預防規律、發明技術。”王辰說,“研究,主要是臨床研究,是一種高級的直接經驗獲取方式。”

王辰把醫生分成三個類別:醫匠、醫師、醫帥。“只有從事研究工作,醫生才能成其圓滿,才能創造先進技術,才能把握、主宰醫學的發展,成長為醫帥。無研究,無以造就好醫生。只有從事研究工作,科室、醫院才能成為先進。”

王辰認為,行醫的過程就是一個研究的過程,是臨床與研究的高度統一。而研究有多種,醫生可以不作基礎研究,但不能不作臨床研究。研究需要總結,以論文形式表述發現、揭示規律。醫生作為知識分子,必然擔負知識創造的責任。

“但目前卻出現了‘中國式的扭曲’。論文的數量等于鈔票的張數,論文的影響因子決定了鈔票的面值。”王辰說,國內對論文的認知出現了偏頗,我們對SCI論文,既不用鞭撻,也不要盲目尊崇。

要成為杰出的“大醫生”,需要不斷學習,積累診療實踐,加強臨床修煉,強化人文素養。“要積極開展臨床研究,創造新的知識、觀念、理論、技術、方法,研究者才能成為醫學的引領者、先驅者。”王辰說。

王辰認為,我國的疾病譜急劇變化,亟待形成科學適宜的防治模式。因此加強臨床研究需求急迫,臨床醫學研究體系與能力建設將會從根本上提升中國的醫療衛生水平。

“研究是醫生從醫匠向醫帥轉化的必由之路,臨床醫生都應是研究者。”王辰認為,應在此前提下,著力于人才隊伍建設,著意于打造專業化的臨床研究隊伍和專業化的數據信息、醫學統計、生物標本庫管理、物流后勤隊伍,改變兼職作坊式、游擊隊式研究現狀。

在王辰看來,發展我國的臨床研究,要打造專業化臨床研究平臺,建設成規模的臨床基地、規范的臨床生物標本庫、專業化的臨床數據庫等,同時加強院際多中心臨床研究網絡等協同體系建設,加強頂層政策引導。“前提是觀念,關鍵是人才,依托是項目,支撐靠IT,運營靠平臺,開放靠協同,引導靠政策。”

日期:2014年12月17日 - 來自[人物專訪]欄目
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美華裔教授獲乳癌杰出研究者獎 亞裔首獲此殊榮


康毅濱獲美國癌癥研究學會2014年度“乳癌杰出研究者獎”。(美國《世界日報》)

據美國《世界日報》報道,美國癌癥研究學會(American Association for Cancer Research,簡稱AACR)日前宣布,本年度“乳癌杰出研究者獎”(Outstanding Investigator Award for Breast Cancer Research)獲獎者為普林斯頓大學分子生物系終身講席教授(Warner-Lambert/Parke-Davis Professor)康毅濱。康毅濱也成為首位獲此獎項的亞裔科學家。

41歲的康毅濱在今年7月剛當選國際癌轉移學會(Metastasis Research Soceity)2016年至2018年度主席,成為該學會史上最年輕的主席,亦是首位亞裔主席。而在9月,投入乳癌研究正好滿十年的康毅濱,獲得全球癌癥研究權威機構的AACR所頒發的該領域“杰出研究者獎”,再創歷史。

據AACR介紹,這一獎項是頒給在乳癌研究領域做出杰出貢獻,成果顯著并廣獲承認的科學家,由全球該領域研究者提名,最終選出一名獲獎者。康毅濱2004年加入普林斯頓大學生物學系,正式開始乳癌研究,至今年9月剛好滿十年。十年磨一劍,康毅濱表示在今年獲頒該獎,更顯意義重大,對十年來的研究成果獲得認可表示欣慰。

在美國,每八位女性中就有一位患有浸潤性乳癌,每年有近4萬人因此的死亡,眾多患者產生致命的化療抗性。康毅濱與其所領導的科研團隊致力于乳癌轉移研究,在近期成功解析了Meadherin(MTDH)基因誘發乳癌腫瘤發生與擴散的分子機制,對乳癌的臨床預防和治療是一大推動。AACR將在12月12日于德州圣安東尼(San Antonio)舉行的第37屆乳癌年會上為康毅濱頒發該獎。

日期:2014年10月10日 - 來自[腫瘤相關]欄目
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